山东省高等教育管理科学研究会专家指导咨询委员会暨学术委员会于2006年9月组建，系研究会建设与发展的参谋咨询组织和智囊团，在研究会理事会领导下，协助研究会领导班子及秘书处，立足“围绕中心，服务大局、服务高校、服务地方”献计献策，并通力合作助推研究会开拓创新，为经济社会发展与高教强省建设贡献智慧和才干。

研究会专家指导咨询委员会：一般由研究会离任副会长、秘书长与各内设机构主要负责人、秘书长且自愿参与的热心人士组成，主要是对研究会发展规划及年度计划安排和重大事项出谋划策、提供咨询，并对研究会及各内设机构策划组织的有关活动与合作项目予以相关指导或提出切实可行的建议。

研究会学术委员会：主要由研究会各团体会员单位（高校）在职领导和高等教育管理科学研究专家学者组成，侧重对研究会学术研究和科学普及方面的交流与合作，以及科研课题立项、成果评价与会议活动举办和研究会学术研究长期规划及年度计划，提出建议与意见。与此同时，会同研究会秘书处及学术合作部拟制有关学术工作规范，并对研究会学术会议与活动做好专业性指导和把关，且提供理论支撑与引领。

研究会专家指导咨询委员会暨学术委员会及其秘书处自建立至今，先后吸纳了多所高校为研究会建设与发展作出贡献的离任和在职党政领导、专家学者。他们在参与中各显其才，各显其能，发挥其作用，作出其贡献，为研究会开拓创新起到积极作用。