山东省高等教育管理科学研究会高等教育研究院，是研究会在2017年6月建立的“高等教育发展研究中心”的基础上，于2019年6月更名并于当年12月授牌设立，系研究会直属研究机构，一直挂靠山东外事职业大学。其合作成员单位，主要是研究会各团体会员单位（高校）内设的高等教育研究院（所、室）等科研单位。

为加强与社会各界从事高等教育研究尤其是高等教育或高等学校管理研究的专家学者，以及热心助力高等教育发展的有识之士，研究会与2024年5月成立了高等教育研究院理事会，广泛联系相关社会组织及其个人，会同研究会高等教育研究院与各高校合作单位协同，设立或申报有关课题、项目，联合召开年会、学术会议以及组织开展高等教育管理科学研究与普及等，助推新时代山东省高等教育高质量发展，并服务高教强省乃至高教强国建设。